iPhone 16eはAppleの新しいカスタムC1 5Gモデムチップを搭載しており、バッテリー効率が向上しています。動画再生時間は最大26時間で、6.1インチのモデルの中では最も長いバッテリーライフを誇ります。また、ストリーミング動画は最大21時間、音楽再生は最大90時間可能です。前世代のiPhone SE 3は最大15時間、同様のサイズのiPhone 16は最大22時間と、16eと比べて劣っています。iPhone 16と16eは共にA18チップを搭載していますが、GPUが異なり、C1モデムチップによる電力消費の違いがあります。iPhone 16はQualcommのモデムチップを使用しており、Appleのモデムはバッテリー性能で顕著な改善があるようです。iPhone 16eはiPhone 16から多くの機能を採用していますが、MagSafe機能は搭載されていません。USB-Cによる高速充電はサポートされていますが、ワイヤレス充電は7.5WのQiスピードに制限され、磁気接続はありません。